Достижения

Разрабатывается комплексный подход для определения степени тяжести неоплазий шейки матки и риска их малигнизации на основе протеомики, метаболомики (прямая масс-спектрометрия тканей) и молекулярной генетики (статьи). Создана панель белков для неинвазивного мониторинга процесса трансформации эпителия шейки матки (статьи) [1-6].

Создан метод прямого экспресс-анализа тканей для дифференциации степени неоплазий шейки матки, эндометриоидных очагов различной локализации, миом матки и рака яичника [7-13]. В основе метода лежит экстракция и одновременная ионизация молекул ткани с последующим анализом с помощью масс-спектрометрии сверхвысокого разрешения. Метод позволяет непосредственно во время хирургической операции верифицировать тип ткани и стадию пролиферативного процесса, дополняя/уточняя результаты патоморфологического исследования. Показана высокая информативность прямой ионизации тканей для дифференциальной диагностики в сравнении с значительно более длительными и трудоемкими методами липидомики (ВЭЖХ-МС/МС анализ органического экстракта тканей, масс-спектрометрический анализ органического экстракта тканей без хроматографии) [7-8].

Разработан подход для дифференциальной диагностики эндометриоза, миомы матки, рака молочной железы и степени злокачественности рака яичника по липидному составу плазмы крови [14-15].

Создан подход к ранней неинвазивной молекулярной диагностике преэклампсии на основе анализа пептидного профиля мочи методом масс-спектрометрии сверхвысокого разрешения. Чувствительность и специфичность разработанного метода диагностики, определения степени тяжести и прогноза течения преэклампсии достоверно превышает существующие на данный момент, в том числе определение отношения sFl-1 и PlGF [16-21].

Создан подход для неинвазивного мониторинга состояния новорожденных путем анализа мочи и конденсата выдыхаемого воздуха. Метод позволяет дифференцировать респираторные патологии инфекционного (врожденная пневмония) и неинфекционного (транзиторное тахипноэ новорожденных, респираторный дистресс синдром) генеза у новорожденных. Результатом является своевременное назначение оптимальной терапии, в том числе антибиотикотерапии [22].

На базе методов прямой масс-спектрометрии создан подход для экспресс-идентификации опухолевой ткани у больных раком молочной железы во время оперативного вмешательства [23-24].

Выполнен цикл работ по определению особенностей низкомолекулярного состава плазмы крови, фолликулярной жидкости, мочи (количественный ВЭЖХ-МС/МС анализ гормонов, органических кислот, поллютантов, аминокислот) при преэклампсии, синдроме задержки развития плода, эндометриозе, повторных неудачах при ЭКО [25-28].

Создан подход для раннего определения риска развития диабета у беременных по липидному профилю в первом-втором триместре беременности [29].

Разработаны подходы для нормирования, последующей статистической обработки липидомных данных с целью повышения качества разделения исследуемых клинических групп [30-31].

Разработан подход для определения пептидов вируса SARS-CoV-2 в плазме крови и тканей методами количественной протеомики [32-33].

Публикации лаборатории

Аттоева Д.И., Асатурова А.В., Назарова Н.М., Прилепская В.Н., Стародубцева Н.Л., Шешко П.Л., Уруймагова А.Т. Сопоставление результатов клинических и морфологических методов исследований при ВПЧ-ассоциированных заболеваниях шейки матки. (ретроспективное исследование) – Гинекология – Т.23 - № 1 – стр. 78-82 DOI: 10.26442/20795696.2021.1.200647

Аттоева Д.И., Стародубцева Н.Л., Назарова Н.М., Токарева А.О., Чаговец В.В., Кукаев Е.Н., Франкевич В.Е., Сухих Г.Т. Поиск маркеров при ВПЧ-ассоциированных поражениях шейки матки методом хромато-масс-спектрометрии. Доктор.Ру. 2021; 20(8): 48–58. DOI: 10.31550/1727-2378-2021-20-8-48-58

Гусаков К.И., Назарова Н.М., Франкевич В.Е., Стародубцева Н.Л., Бурменская О.В., Прилепская В.Н., Сухих Г.Т. Результаты генотипирования вируса папилломы человека у женщин репродуктивного возраста, вакцинированных от вируса папилломы человека// Акушерство и гинекология. 2020; 9: 114-119 https://dx.doi.org/10.18565/aig.2020.9.114-119

Н.Л. Стародубцева, А. Г. Бржозовский, А.Е. Бугрова, А.С. Кононихин, Гусаков К.И., Н.М. Назарова, В.Е. Франкевич Характеристика динамических изменений протеомного состава цервиковагинальной жидкости при заболеваниях шейки матки, ассоциированных с ВПЧ-инфекцией// Акушерство и гинекология. 2020; 7: 111-116 https://dx.doi.org/10.18565/aig.2020.7.111-116

Natalia L. Starodubtseva, Alexander G. Brzhozovzkiy, Alexey S. Kononikhin, Anna E. Bugrova, Niso M. Nazarova, Kiril I. Gusakov, Maria I. Indeykina, Vitaliy V. Chagovets, Vladimir E. Frankevich, Eugene N. Nikolaev, Gennady T. Sukhikh Label‐free cervicovaginal fluid proteome profiling reflects the cervix neoplastic transformation// J Mass Spectrom. 2019 Aug;54(8):693-703. doi: 10.1002/jms.4374. Impact factor = 2.267

Некрасова М.Е., Чаговец В.В., Стародубцева Н.Л., Кононихин А.С., Салимова Д.Ф., Токарева А.О., Лагутин В.В., Наумов В.А., Назарова Н.М., Франкевич В.Е., Сухих Г.Т. Липидные маркеры неопластической трансформации эпителия шейки матки при заболеваниях, ассоциированных с вирусом папилломы человека. Акушерство и гинекология. 2018; 4: 64-70. https://dx.doi.org/10.18565/aig.2018.4.64-70

Vladimir Frankevich; Vitaliy Chagovets; Alisa Tokareva; Natalia Starodubtseva; Aleksey Kononikhin; Konstantin Chingin; Huanwen Chen; and Gennady Sukhikh Combination of Low-Temperature Electrosurgical Unit and Extractive Electrospray Ionization Mass Spectrometry for Molecular Profiling and Classification of Tissues// Molecules, 2019; 24(16), 2957; https://doi.org/10.3390/molecules24162957 Q1 Impact factor = 4.148, Q1

Chagovets, V., Wang, Z., Kononikhin, A., Starodubtseva, N., Borisova, A., Salimova, D., Popov, I., Kozachenko, A., Chingin, K., Chen, H., Frankevich, V., Adamyan, L., Sukhikh, G. A Comparison of Tissue Spray and Lipid Extract Direct Injection Electrospray Ionization Mass Spectrometry for the Differentiation of Eutopic and Ectopic Endometrial Tissues (2018) Journal of the American Society for Mass Spectrometry, 29 (2), pp. 323-330. doi: 10.1007/s13361-017-1792-y. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/28956319 Impact factor - 2.655, Q1

Narine M. Tonoyan, Vitaliy V. Chagovets, Natalia L. Starodubtseva, Alisa O. Tokareva, Konstantin Chingin, Irena F. Kozachenko, Leyla V. Adamyan1, Vladimir E. Frankevich Alterations in lipid profile upon uterine fibroids and its recurrence // Scientific Reports, 11, Article number: 11447 (2021) https://doi.org/10.1038/s41598-021-89859-0 Impact factor = 4.13, Q1

12. Adamyan, L., Starodubtseva, N., Borisova, A., Stepanian, A., Chagovets, V., Salimova, D., Wang, Z., Kononikhin, A., Popov, I., Bugrova, A., Chingin, K., Kozachenko, A., Chen, H., Frankevich, V. Direct Mass Spectrometry Differentiation of Ectopic and Eutopic Endometrium in Patients with Endometriosis // Journal of Minimally Invasive Gynecology. Volume 25, Issue 3, March–April 2018, Pages 426-433.  doi.org/10.1016/j.jmig.2017.08.658 Impact factor = 1.792 https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1553465017311202?via%3Dihub

13. Chagovets, V.V., Wang, Z., Kononikhin, A.S., Starodubtseva, N.L., Borisova, A., Salimova, D., Popov, I.A., Kozachenko, A.V., Chingin, K., Chen, H., Frankevich, V.E., Adamyan, L.V., Sukhikh, G.T. Endometriosis foci differentiation by rapid lipid profiling using tissue spray ionization and high resolution mass spectrometry (2017) Scientific Reports, 7 (1), № 2546. doi:10.1038/s41598-017-02708-x. Impact factor = 4.85, Q1 https://www.nature.com/articles/s41598-017-02708-x

14.      Юрова М.В., Чаговец В.В., Франкевич В.Е., Стародубцева Н.Л., Хабас Г.Н., Павлович С.В. Дифференциация серозных новообразований яичников на основании масс-спектрометрического анализа липидного профиля сыворотки крови: пилотное исследование. Акушерство и гинекология. 2021; 9: https://dx.doi.org/10.18565/aig.2021.9

15.      Natalia Starodubtseva; Vitaliy Chagovets; Dinara Salimova; Natalia Aleksandrova; Anna Borisova; Konstantin Chingin; Huanwen Chen; Vladimir Frankevich Identification of potential endometriosis biomarkers in peritoneal fluid and blood plasma via shotgun lipidomics// J Clin MS Volume 13, August 2019, Pages 21-26   10.1016/j.clinms.2019.05.007 Impact factor=1.25

16.      Караваева А.Л., Зубков В.В., Стародубцева Н.Л., Тимофеева Л.А., Кан Н.Е., Тютюнник В.Л., Баев О.Р., Низяева Н.В. Взаимосвязь содержания специфического протеина SERPINA1 в моче беременных с тяжестью преэклампсии и перинатальными исходами Акушерство и гинекология. 2021; 9: https://dx.doi.org/10.18565/aig.2021.9.

17.      Natalia Starodubtseva, Natalia Nizyaeva, Oleg Baev, Anna Bugrova, Masara Gapaeva, Kamilla Muminova, Alexey Kononikhin, Vladimir Frankevich, Eugene Nikolaev and Gennady Sukhikh SERPINA1 Peptides in Urine as A Potential Marker of Preeclampsia Severity// Int. J. Mol. Sci. 2020, 21, 914. Impact factor 5.542, Q1

18.      Alexey Kononikhin, Natalia V. Zakharova, Viktoria A. Sergeeva, Maria I. Indeykina, Natalia L. Starodubtseva, Anna E. Bugrova, Kamila T. Muminova, Zulfia S. Khodzhaeva, Igor A. Popov, Wenguang Shao, Patrik Pedrioli, Roman G. Shmakov, Vladimir E. Frankevich, Gennady T. Sukhikh, Evgeny N Nikolaev Differential diagnosis of preeclampsia based on urine peptidome featches revealed by high resolution mass spectrometry // Diagnostics 2020, 10, 1039; doi:10.3390/diagnostics10121039 Impact factor = 3.11

19.      Victoria A. Sergeeva, Natalia V. Zakharova, Anna E. Bugrova, Natalia L. Starodubtseva, Maria I. Indeykina, Alexey S. Kononikhin, Vladimir E. Frankevich, Eugene N. Nikolaev The high-resolution mass spectrometry study of the protein composition of amyloid-like urine aggregates associated with preeclampsia// EJMS, 2019 Jul 10:1469066719860076. doi: 10.1177/1469066719860076  Impact factor = 1.011.

20.      Муминова К.Т., Кононихин А.С., Ходжаева З.С., Шмаков Р.Г., Сергеева В.А., Стародубцева Н.Л., Бугрова А.Е., Индейкина М.И., Захарова Н.В., Франкевич В.Е., Кан Н.Е., Николаев Е.Н., Сухих Г.Т. Дифференциальная диагностика гипертензивных состояний во время беременности при помощи анализа пептидомного профиля мочи. Акушерство и гинекология. 2018; 8: 66-75. https://dx.doi.org/10.18565/aig.2018.8.66-75

21.      Kononikhin, A.S., Sergeeva, V.A., Bugrova, A.E., Indeykina, M.I., Starodubtseva, N.L., Chagovets, V.V., Popov, I.A., Frankevich, V.E., Pedrioli, P., Sukhikh, G.T., Nikolaev, E.N. Methodology for urine peptidome analysis based on nano-HPLC coupled to fourier transform ion cyclotron resonance mass spectrometry// Methods in Molecular Biology, 2018, 1719, pp. 311-318. DOI: 10.1007/978-1-4939-7537-2_20

22.      Kononikhin AS, Starodubtseva NL, Chagovets VV, Ryndin AY, Burov AA, Popov IA, Bugrova AE, Dautov RA, Tokareva AO, Podurovskaya YL, Ionov OV, Frankevich VE, Nikolaev EN, Sukhikh GT. Exhaled breath condensate analysis from intubated newborns by nano-HPLC coupled to high resolution MS. J Chromatogr B Analyt Technol Biomed Life Sci. 2017 Mar 15;1047:97-105. doi: 10.1016/j.jchromb.2016.12.036. Impact factor = 2.987 https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1570023216314696?via%3Dihub

23.      Токарева А.О, Чаговец В.В., Родионов В.В., Кометова В.В., Родионова М.В., Стародубцева Н.Л., Франкевич В.Е Липидные маркеры метастатического поражения регионарных лимфоузлов у больных раком молочной железы в тканях молочной железы// Акушерство и гинекология. 2020; 8: 133-140 https://dx.doi.org/10.18565/aig.2020.8.133-140

24.      Chagovets Vitaliy, Starodubtseva Natalia, Tokareva Alisa, Frankevich Vladimir, Rodionov Valerii, Kometova Vlada, Chignin Konstantin, Kukaev Eugene, Chen Huanwen, Sukhikh Gennady (2020) Validation of Breast Cancer Margins by Tissue Spray Mass Spectrometry. International Journal of Molecular Sciences. 21. 4568. 10.3390/ijms21124568. Impact factor = 5.542, Q1

25.      Marina Nikolaeva, Alla Arefieva, Alina Babayan, Vitaliy Chagovets, Natalia Kitsilovskaya, Natalia Starodubtseva, Vladimir Frankevich, Elena Kalinina, Lubov Krechetova, Gennady Sukhikh Immunoendocrine markers of stress in seminal plasma at ivf/icsi failure: a preliminary study// Reprod Sci. 2021, 28(1), pp. 144-158. doi: 10.1007/s43032-020-00253-z  - Impact factor = 2.55

26.      Сыркашева А.Г., Киндышева С.В., Стародубцева Н.Л., Франкевич В.Е., Долгушина Н.В. Бисфенол А в организме пациенток с бесплодием: влияние на результаты программ вспомогательных репродуктивных технологий. Акушерство и гинекология. 2021; 5: 113-120 https://dx.doi.org/10.18565/aig.2021.5.113-120

27.      Павлович С.В., Юрова М.В., Чаговец В.В., Франкевич В.Е., Стародубцева Н.Л., Чупрынин В.Д., Сухих Г.Т. Особенности профиля стероидных гормонов крови пациентов репродуктивного возраста с распространенным эндометриозом. Акушерство и гинекология. 2021; 3: 90-100 https://dx.doi.org/10.18565/aig.2021.3.90-100

28.      Кан Н.Е., Хачатрян З.В., Чаговец В.В., Стародубцева Н.Л., Амирасланов Э.Ю., Тютюнник В.Л., Ломова Н.А. Франкевич В.Е. Анализ метаболических путей при задержке роста плода // Биомедицинская химия, 2020, 66(2), 174-180 10.18097/PBMC20206602174

29.      Одинокова В.А., Чаговец В.В., Шмаков Р.Г., Стародубцева Н.Л., Салимова Д.Ф., Кононихин А.С., Франкевич В.Е. Особенности липидома сыворотки крови беременных при макросомии плода и сочетании макросомии с гестационным сахарным диабетом// Акушерство и гинекология, 2019, 12, с. 44-51

30.      Alisa O. Tokareva, Vitaliy V. Chagovets, Alexey S. Kononikhin, Natalia L. Starodubtseva, Vladimir. E. Frankevich, Evgeny N. Nikolaev Comparative analysis of variable selection method’s effectiveness for creation biomarker diagnostic panel in case of mass-spectrometry lipidomic analysis// JMS, Volume56, Issue3, 2021, e4702 https://doi.org/10.1002/jms.4702 Impact factor = 1.736

31.      Tokareva A.O., Chagovets V.V., Kononikhin A.S., Starodubtseva N.L., Nikolaev E.N., Frankevich V.E. Normalization methods for reducing interbatch effect without quality control samples in liquid chromatography-mass spectrometry-based studies. Anal Bioanal Chem (2021). https://doi.org/10.1007/s00216-021-03294-8 Impact factor = 3.7, Q1

32.      Sukhikh, G.; Petrova, U.; Prikhodko, A.; Starodubtseva, N.; Chingin, K.; Chen, H.; Bugrova, A.; Kononikhin, A.; Bourmenskaya, O.; Brzhozovskiy, A.; Polushkina, E.; Kulikova, G.; Shchegolev, A.; Trofimov, D.; Frankevich, V.; Nikolaev, E.; Shmakov, R.G. Vertical Transmission of SARS-CoV-2 in Second Trimester Associated with Severe Neonatal Pathology. Viruses 2021, 13, 447. https://doi.org/10.3390/v13030447 Impact factor = 4.911, Q1

33.      Evgeny N.Nikolaev, Maria I.Indeykina, Alexander G.Brzhozovskiy, Anna E.Bugrova, Alexey S.Kononikhin, Natalia L.Starodubtseva, Evgeny V.Petrotchenko, Grigoriy I.Kovalev, Christoph H.Borchers, Gennadiy T.Sukhikh Mass Spectrometric detection of SARS-CoV-2 virus in scrapings of the epithelium of the nasopharynx of infected patients via Nucleocapsid N protein// Journal of Proteome Research. 2020. doi:10.1021/acs.jproteome.0c00412 Impact factor = 4.219, Q1