Оборудование лаборатории

1)            Высококачественная система визуализации ChemiDocTM MP Imaging System производства компании BioRad для документирования результатов гель-электрофореза и Вестерн-блоттинга, хемилюминесценции и мультиплексного флуоресцентного блоттинга

2)            Амплификатор нуклеиновых кислот в режиме реального времени CFX96TM Real-Time System производства компании BioRad

3)            Амплификатор нуклеиновых кислот в режиме реального времени StepOnePlus Real-Time PCR System производства компании AppliedBiosystems

4)            Система QIAcuity One (5plex) для цифровой ПЦР в нанопланшетах производства компании Qiagen

5)            Станция Chromium™ X производства компании 10x Genomics для быстрого инкапсулирования одиночных клеток в тысячи индивидуальных эмульсионных капель с гелевыми частицами (GEMs), каждая из которых содержит уникальный баркод для мультиплексирования

6)            Роботизированная станция для выделения нуклеиновых кислот и белков QIAcube колоночным способом производства компании Qiagen

7)            Центрифуга SL16R с охлаждением (-10 °С) – (+4 °С) производства компании Thermo Scientific

8)            Система автоматизированного электрофореза 2100 Bioanalyzer производства компании Agilent для быстрого и надежного разделения, качественного и количественного анализа нуклеиновых кислот методом капиллярного электрофореза на чипе.

9)            Система полусухого блоттинга Trans-Blot® Turbo Transfer System производства компании BioRad

Достижения

Основные достижения лаборатории прикладной транскриптомики:

1. Разработан алгоритм проведения скрининга первого триместра беременности по выявлению преэклампсии и патологического прикрепления плаценты по уровню малых некодирующих РНК в сыворотке крови
2. Предложен инновационный способ оценки плоидности клеток бластоцисты и ее имплантационного потенциала по уровню внеклеточных piwiРНК в среде культивирования
3. Разработан малоинвазивный метод оценки рецептивного эндометрия по уровню малых некодирующих РНК в маточном аспирате при проведении цикла ЭКО
4. Найдены ключевые молекулы, участвующие в патогенезе РДС у новорожденных от матерей с патологическим прикреплением плаценты
5. Предложен инновационный способ лечения гипоплазии легких при ВДГ путем эндотрахеального введения синтетических аналогов микроРНК
6. Предложен метод неинвазивной оценки нарушений развития нервной системы плода в качестве платформы для «жидкостной биопсии мозга» при плацента-ассоциированных заболеваниях

В стенах лаборатории прикладной транскриптомики выполнены исследования в рамках диссертационных работ:

1. Прозоровской Ксении Николаевны на тему «Особенности профиля микроРНК при преэклампсии различной степени тяжести».
2. Ганичкиной Марии Борисовны на тему «Диагностика задержки роста плода на основе оценки паттернов экспрессии регулирующих окислительный стресс микроРНК и маркеров про- и антиоксидантной систем»
3. Пироговой Марии Михайловны на тему «Роль неинвазивных методов диагностики в оптимизации акушерской тактики при врастании и предлежании плаценты
4. Драпкиной Юлии Сергеевны на тему «Оптимизация и индивидуализация программ вспомогательных репродуктивных технологий с использованием профиля экспрессии малых некодирующих РНК в культуральной среде эмбриона»
5. Шаминой Марии Александровны на тему «Оптимизация лечения бесплодия у пациентов с повторным отсутствием имплантации эмбриона на основании оценки профиля экспрессии малых некодлирующих РНК»
6. Савостиной Гузель Венеровны на тему: «Оптимизация вспомогательных репродуктивных технологий на основании селективного переноса эуплоидного эмбриона с учетом профиля экспрессии малых некодирующих рибонуклеиновых кислот в культуральной среде эмбрионов»
7. Гохберг Яэль Александровны на тему: «Индивидуализация программ вспомогательных репродуктивных технологий с переносом размороженного эмбриона на основании оценки особенностей экспрессии малых некодирующих РНК в секрете эндометрия»
8. Снетковой Нины Викторовны на тему «Клинические и молекулярно-биологические детерминанты формирования гестационного сахарного диабета»
9. Абрамовой Марии Евгеньевны на тему «Оптимизация тактики ведения беременных с гестационным сахарным диабетом»
10.  Никонец Анастасии Дмитриевны на тему «Молекулярно-биологические предикторы тяжелых дыхательных и сердечно-сосудистых нарушений у детей, рожденных у матерей с врастанием плаценты»
11.  Гайдаровой Асият Руслановны на тему «Оптимизация тактики преиндукции родов с учетом экспрессии сигнальных молекул инициации родовой деятельности»
12.  Никитиной Ирины Владимировны на тему «Персонифицированные подходы к диагностике и лечению инфекционно-воспалительных заболеваний у недоношенных детей»
13.  Асатуровой Александры Вячеславовны на тему: «Гиперпластические изменения и интраэпителиальные поражения слизистой оболочки маточной трубы и их значение в морфогенезе серозных опухолей яичника»
14.  Волочаевой Марии Вячеславовны на тему: «Принципы ведения беременности при различных формах задержки роста плода в зависимости от этиопатогенетических особенностей заболевания»

Публикации лаборатории

Наиболее значимые публикации в отечественных и зарубежных журналах:

1. Timofeeva AV, Gusar VA, Kan NE, Prozorovskaya KN, Karapetyan AO, Bayev OR, Chagovets VV, Kliver SF, Iakovishina DY, Frankevich VE, Sukhikh GT. Identification of potential early biomarkers of preeclampsia. Placenta. 2018 Jan;61:61-71. doi: 10.1016/j.placenta.2017.11.011. Epub 2017 Nov 21. Erratum in: Placenta. 2018 Mar;63:61. doi: 10.1016/j.placenta.2018.01.007. PMID: 29277273.
2. Blood Plasma Small Non-Coding RNAs as Diagnostic Molecules for the Progesterone-Receptor-Negative Phenotype of Serous Ovarian Tumors / A. V. Timofeeva, I. S. Fedorov, A. V. Asaturova [et al.] // International Journal of Molecular Sciences. – 2023. – Vol.24, No. 15. – P. 12214. – DOI 10.3390/ijms241512214.
3. Search for new participants in the pathogenesis of high-grade serous ovarian cancer with the potential to be used as diagnostic molecules / A. V. Timofeeva, A. V. Asaturova, M. V. Sannikova [et al.] // Life. – 2022. – Vol. 12, No. 12. – P. 2017. – DOI 103390/life12122017.
4. The Impact of Maternal SARS-CoV-2 Infection Next to Pre-Immunization with Gam-COVID-Vac (Sputnik V) Vaccine on the 1-Day-Neonate's Blood Plasma Small Non-Coding RNA Profile: A Pilot Study / A. V. Timofeeva, I. S. Fedorov, V. V. Chagovets [et al.] // COVI. – 2022. – Vol. 2, No. 7. – P. 837-857. – DOI 10.3390/covid2070061
5. MiRNAs and their gene targets – a clue to differentiate pregnancies with small for gestational age newborns, intrauterine growth restriction, and preeclampsia / A. V. Timofeeva, I. S. Fedorov, A. G. Brzhozovskiy [et al.] // Diagnostics. – 2021. – Vol. 11, o. 4. – DOI 10.3390/DIAGNOSTICS11040729
6. Interrelation between miRNAs expression associated with redox state fluctuations, immune and inflammatory response activation, and neonatal outcomes in complicated pregnancy, accompanied by placental insufficiency / V. A. Gusar, A. V. Timofeeva, V. V. Chgovets [et al.] // Antioxidants. – 2023. – Vol. 12, No. 1. – P. 6. – DOI 10.3390/antiox12010006.
7. Regulation of the placental growth factor mediated by sumoylation and expression of miR-652-3p in pregnant women with early-onset preeclampsia / V. A. Gusar, A. V. Timofeeva, V. V. Chagovets [et al.] // Bulletin of Experimental Biology and Medicine. – 202. – Vol. 174, No. 1. – P. 174-178. – DOI 10.1007/s10517-022-05668-z
8. Diagnostic Role of Cell-Free miRNAs in Identifying Placenta Accreta Spectrum during First-Trimester Screening / A. V. Timofeeva, I. S. Fedorov, Y. V. Suhova [et al.] // International Journal of Molecular Sciences. – 2024. – Vol. 25, No. 2. – P. 871. – DO 10.3390/ijms25020871
9. Prediction of early-and late-onset pre-eclampsia in the preclinical stage via placenta-specific extracellular miRNA profiling / A. V. Timofeeva, I. S. Fedorov, Yu. V. Sukhova [et al.] // International Journal of Molecular Sciences. – 2023. – Vol. 24, No.9. – P. 8006. – DOI 10.3390/ijms2409800
10. Extracellular vesicles of human glial cells exert neuroprotective effects via brain miRNA modulation in a rat model of traumatic brain injury / D. I. Salikhova, A. V. Timofeeva, V. V. Golovicheva [et al.] // Scientific Reports. – 2023. – Vol. 13, No. 1.  P. 20388. – DOI 10.1038/s41598-023-47627-2
11. Clinical Relevance of Secreted Small Noncoding RNAs in an Embryo Implantation Potential Prediction at Morula and Blastocyst Development Stages / A. V. Timofeeva, I. S. Fedorov, M. A. Shamina [et al.] // Life. – 2021. – Vol. 11, No. 12. – P. 1328. – DOI 1.3390/life11121328
12. Diagnostic Role of Cell-Free miRNAs in Identifying Placenta Accreta Spectrum during First-Trimester Screening / A. V. Timofeeva, I. S. Fedorov, Y. V. Suhova [et al.] // International Journal of Molecular Sciences. – 2024. – Vol. 25, No. 2. – P. 871. – DOI 10.3390/ijms25020871
13. Clusterin and its potential regulatory micrornas as a part of secretome for the diagnosis of abnormally invasive placenta: Accreta, increta, and percreta cases / A. V. Timofeeva, I. S. Fedorov, M. M. Pirogova [et al.] // Life. – 2021. – Vol. 11, No. 4. – P. 270. – DOI 10.3390/life11040270
14. Small noncoding RNA signatures for determining the developmental potential of an embryo at the morula stage / A. Timofeeva, Y. Drapkina, I. Fedorov [et al.] // International Journal of Molecular Sciences. – 2020. – Vol. 21, No. 24. – P. 1-25. – DOI 10.3390/ijms21249399.
15. Оценка рецептивности эндометрия по уровню малых некодирующих РНК в маточном аспирате у женщин на фоне циклической гормональной терапии / А. В. Тимофеева, И. С. Федоров, Я. А. Гохберг, Е. А. Калинина // Акушерство и гинекология. – 2023. – № 7. – С. 90-102. – DOI 10.18565/aig.2023.110.
16. Количественный анализ piwiРНК в среде культивирования эуплоидных и анеуплоидных бластоцист как вспомогательный способ отбора качественного эмбриона для переноса в полость матки в программах вспомогательных репродуктивных технологий / А. В. Тимофеева, И. С. Федоров, Г. В. Савостина [и др.] // Акушерство и гинекология. – 2023. – № 11. – С. 115-130. – DOI 10.18565/aig.2023.180.
17. Novye vozmozhnosti prognozirovaniya preeklampsii na osnove ekspressii ekzosomnyh belkov SUMO / В. А. Гусар, А. В. Тимофеева, И. С. Федоров [et al.] // Вестник Российского государственного медицинского университета. – 2024. – No. 1. – DOI 10.24075/vrgmu.2024.010.
18. Increased Levels of hsa-miR-199a-3p and hsa-miR-382-5p in Maternal and Neonatal Blood Plasma in the Case of Placenta Accreta Spectrum / A. V. Timofeeva, I. S. Fedorov, A. D. Nikonets [et al.] // International Journal of Molecular Sciences. – 2024. – Vol. 25, No. 24. – P. 13309. – DOI 10.3390/ijms252413309.
19. Сравнительный анализ клинико-анамнестических данных супружеских пар при переносе размороженного эмбриона в естественном цикле и в цикле заместительной гормональной терапии / Я. А. Гохберг, И. С. Федоров, А. В. Тимофеева, Е. А. Калинина // Акушерство и гинекология. – 2022. – № 9. – С. 72-80. – DOI 10.18565/aig.2022.9.72-80.
20. Влияние прегравидарной подготовки на качество ооцитов пациенток в рамках проведения программ вспомогательных репродуктивных технологий / М. А. Шамина, А. В. Тимофеева, И. С. Федоров, Е. А. Калинина // Акушерство и гинекология. – 2021. – № 11. – С. 143-153. – DOI 10.18565/aig.2021.11.143-153
21. Timofeeva AV, Chagovets VV, Drapkina YS, Makarova NP, Kalinina EA, Sukhikh GT. Cell-Free, Embryo-Specific sncRNA as a Molecular Biological Bridge between Patient Fertility and IVF Efficiency. Int J Mol Sci. 2019 Jun 14;20(12):2912. doi: 10.3390/ijms20122912. PMID: 31207900; PMCID: PMC6627040.
22. Sysoeva AP, Nepsha OS, Makarova NP, Silachev DN, Lobanova NN, Timofeeva AV, Shevtsova YA, Bragina EE, Kalinina EA. Influence of Extracellular Vesicles from the Follicular Fluid of Young Women and Women of Advanced Maternal Age with Different miRNA Profiles on Sperm Functional Properties. Bull Exp Biol Med. 2022 Aug;173(4):560-568. doi: 10.1007/s10517-022-05589-x. Epub 2022 Sep 12. PMID: 36094592.
23. Timofeeva A.V., Fedorov I.S., Tarasova A.M., Sukhova Yu.V., Kolodyko V.G., Ivanets T.Yu., Sukhikh G.T. Universal first trimester screening biomarkers for diagnosis of preeclampsia and placenta accreta spectrum. Biomolecules 2024; preprints-142939, DOI: 10.20944/preprints202412.1330.v1
24. Патент № 2688169 C1 Российская Федерация, МПК G01N 33/574, C12Q 1/68. Количественная оценка has-miR-16-5p, has-miR-425-5p, has-miR-17-5p, has-miR-20a-5p, has-miR-101-3p, has-miR-30d-5p и has-miR-93-5p в плазме периферической крови женщин как способ неинвазивной диагностики серозных пограничных цистаденом и цистаденокарцином яичника : № 2018129534 : заявл. 14.08.2018 : опубл. 20.05.2019 / А. В. Тимофеева, В. В. Чаговец, А. В. Асатурова [и др.] ; заявитель Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный медицинский исследовательский центр акушерства, гинекологии и перинатологии имени академика В.И. Кулакова" Министерства здравоохранения Российской Федерации
25.  Патент № 2771205 C1 Российская Федерация, МПК G01N 33/58, C12Q 1/6806, C12Q 1/6851. Количественная оценка соотношения hsa-miR-30c-5/VIM, hsa-miR-28-3p/VIM, hsa-miR-1-3p/ANXA2, hsa-miR-30c-5p/FBN1, hsa-miR-15b-5p/MYL6 tr.v.1, hsa-miR-15b-5p/MYL6 tr.v.2, hsa-miR-185-3p/FLNA, hsa-miR-1-3p/YWHAZ, hsa-miR-30c-5p/YWHAZ и hsa-miR-654-3p/FGA в плацентарной площадке женщин в день родоразрешения на сроке более 34 недель гестации как способ дифференциальной диагностики синдрома задержки развития плода, преэклампсии и синдрома маловесного к сроку гестации плода : № 2021102705 : заявл. 05.02.2021 : опубл. 28.04.2022 / А. В. Тимофеева, И. С. Федоров, В. В. Чаговец [и др.] ; заявитель федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный медицинский исследовательский центр акушерства, гинекологии и перинатологии имени академика В.И. Кулакова" Министерства здравоохранения Российской Федерации

О наших достижениях пишут: https://gentech.ntr.ru/uchenyj-iz-moskvy-rasskazala-ob-issledovanii-nekodiruyushhih-rnk-kak-perspektivnyh-biomarkerov-v-reproduktivnoj-meditsine/